物种分化时间贝叶斯估计的不同分区策略评估数据集

数据集概述

本数据集围绕物种分化时间贝叶斯估计的分区策略展开,通过计算机模拟和真实数据分析,研究不同分区方案对分化时间估计结果的影响,包括分区数量、化石校准冲突等因素的作用,为系统发育分析中的数据分区方法提供实证依据。

文件详解

  • 文件名称: PartitionAnalysisTimeMC.FigS1.pdf
  • 文件格式: PDF
  • 内容: 包含补充图表(图S1),可能展示分区策略对分化时间估计影响的可视化结果
  • 文件名称: RelClock.R
  • 文件格式: R脚本
  • 内容: 用于实现松弛时钟模型(Relaxed-clock model)的R语言代码,可能涉及分化时间估计的计算逻辑
  • 文件名称: MakeTree.R
  • 文件格式: R脚本
  • 内容: 用于构建系统发育树的R语言代码,可能包含树结构生成或可视化的相关函数
  • 文件名称: PartitionAnalysisTimeMC.TableS1S2.xlsx
  • 文件格式: Excel表格
  • 内容: 包含补充表格(表S1、表S2),可能记录不同分区方案下分化时间估计的具体数值结果或统计指标

适用场景

  • 系统发育学研究: 分析不同分区策略对物种分化时间贝叶斯估计准确性的影响
  • 分子进化分析: 探究分区方案、化石校准冲突等因素对松弛时钟模型结果的作用机制
  • 生物信息学方法优化: 为实际系统发育分析中数据分区方法的选择提供参考依据
  • 植物进化研究: 基于15种植物78个质体基因的真实数据集,验证分区策略在时钟严重违反场景下的应用效果
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.15 MiB
最后更新 2025年12月16日
创建于 2025年12月16日
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