X_chromosome_Based_哺乳动物X染色体基因表达限制与内容分析数据

数据集概述

本数据集围绕哺乳动物X染色体基因内容展开研究,探讨单倍体表达导致的最大表达水平限制对X染色体基因内容的影响。通过ENCODE和FANTOM5项目数据验证假设,分析X染色体与常染色体基因的最大表达差异、逆转录事件相关表达变化及组织特异性表达特征,包含14个相关文件。

文件详解

  • 数据文件(.txt、.csv、.xlsx)
  • 基因表达数据文件:如human.tissue.hCAGE.hg19.tpm.refgene.osc.txt(TXT格式)、raw_Z_Exp_Anc_L.csv(CSV格式),包含基因表达量(TPM值)、染色体位置、表达相关Z分数等字段
  • 图表支撑数据文件:如FigS3_data.txt(TXT格式)、Fig7_data.txt(TXT格式),为研究中的图表提供原始数据
  • 补充表格文件:SUPPLEMENTARY TABLES.xlsx(XLSX格式),包含研究相关的补充表格信息
  • 说明性文件
  • 实验说明文件:如README_for_chicken.all_samples.galGal3.tpm.refgene.osc.txt(TXT格式),介绍样本及数据相关信息
  • 其他文件
  • env_duplicator_base(无扩展名)等,可能为研究过程中的辅助文件

数据来源

论文“The constrained maximal expression level owing to haploidy shapes gene content on the mammalian X chromosome”

适用场景

  • 哺乳动物X染色体基因研究:分析X染色体基因内容特征及表达限制机制
  • 基因表达差异分析:对比X染色体与常染色体基因的最大表达水平差异
  • 生物进化研究:探究单倍体表达对基因内容进化的影响
  • 基因表达数据验证:验证ENCODE和FANTOM5项目数据在X染色体基因研究中的应用价值
  • 组织特异性基因表达分析:研究不同组织中X染色体基因的表达特征
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 284.14 MiB
最后更新 2026年1月15日
创建于 2026年1月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。