数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了trpa-2(tm3085)I品系成虫在特定培养条件下的行为实验数据。包含实验环境参数、视频跟踪数据及行为特征提取结果,可用于研究trpa-2基因对秀丽隐杆线虫行为的影响,总计3个文件。
文件详解
- 行为跟踪数据文件
- 文件名称:MO5B5.6 (tm3085) on food L_2010_07_06__10_44_2823.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为视频的原始跟踪数据,记录实验过程中线虫的运动轨迹等基础行为信息
- 行为特征数据文件
- 文件名称:MO5B5.6 (tm3085) on food L_2010_07_06__10_44_2823_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含从视频中提取的线虫行为特征数据,如骨架分段信息等,用于量化分析行为模式
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:MO5B5.6 (tm3085) on food L_2010_07_06__10_44_2823.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的行为数据文件,包含实验相关的结构化行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析trpa-2基因缺失对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 线虫行为学分析:基于视频跟踪数据研究线虫在特定培养条件下的运动、觅食等行为特征
- 实验方法验证:参考实验方案(E. Yemini et al.方法)验证线虫行为学实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用:测试和优化tierpsy等线虫行为跟踪软件的性能与特征提取效果