数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了IK130 pkc-1(nj3)V株系成虫的行为实验数据。实验于2010年7月27日在英国MRC分子生物学实验室开展,通过视频跟踪获取线虫在NGM培养基上的运动特征,包含运动轨迹、骨架分割等行为数据,用于研究pkc-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_27__13_1437_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含基于视频跟踪提取的运动参数(如速度、弯曲度等)、骨架分割信息(共21120个分割骨架)
- 原始行为数据文件
- 文件名称:pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_27__13_1437.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始行为数据,包含视频帧对应的线虫位置、姿态等基础观测数据
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_27__13_1437.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,格式遵循wcon标准,包含实验过程中线虫的运动轨迹时间序列数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经基因功能研究: 分析pkc-1基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制
- 模式生物行为表型分析: 基于视频跟踪数据研究线虫成虫在食物环境中的运动模式、探索行为等表型特征
- 行为学实验方法验证: 参考实验方案(如30分钟适应期、视频跟踪参数)优化秀丽隐杆线虫行为实验设计
- 基因-行为关联分析: 对比野生型与pkc-1突变株系的行为差异,构建基因功能与行为表型的关联模型