数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB2030菌株(携带nlp-3基因ok2688突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为观测结果,包含实验参数、视频追踪数据及特征提取结果,总计3个文件。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:nlp-3 (ok2688)X on food R_2010_03_18__12_36_14__8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含20067个分割骨架数据,对应实验总时长898.762秒、帧率25.9067帧/秒、像素分辨率4.3011微米/像素
- 文件名称:nlp-3 (ok2688)X on food R_2010_03_18__12_36_14__8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储行为特征提取结果,包含由tierpsy软件计算的线虫运动行为量化特征
- 归档文件
- 文件名称:nlp-3 (ok2688)X on food R_2010_03_18__12_36_14__8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的WCON格式归档文件
数据来源
William R Schafer实验室(MRC Laboratory of Molecular Biology, UK)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-3基因ok2688突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学实验验证: 验证神经肽基因调控线虫行为的分子机制
- 行为学实验方法优化: 基于实验参数(如 habituation时长、培养介质)优化线虫行为观测方案
- 生物图像追踪技术应用: 利用tierpsy软件的追踪数据开展行为特征提取算法研究