数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)CB755品系(基因型unc-43(e755)IV)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为特征,包括视频追踪数据及提取的行为特征,可用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:unc-43 (e755)IV on food R_2010_08_20__12_20_17__6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,基于视频追踪的骨架分割结果(共18990个分割骨架)
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:unc-43 (e755)IV on food R_2010_08_20__12_20_17__6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储视频追踪得到的线虫运动原始数据,关联参数包括帧率(30.03帧/秒)、像素分辨率(4.56732微米/像素)
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:unc-43 (e755)IV on food R_2010_08_20__12_20_17__6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩包,记录实验总时长(898.967秒)内的行为轨迹信息
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析unc-43基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 神经行为学分析: 基于视频追踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等特征
- 模式生物行为数据库构建: 补充线虫行为数据库的实验数据,支持大规模行为组学研究
- 生物图像分析算法验证: 用于验证tierpsy等线虫行为追踪软件的特征提取准确性
- 药物筛选辅助: 可作为基因突变体行为基线数据,用于药物处理后的行为变化对比分析