数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)ins-11(tm1053)II品系的行为实验数据,属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养基中的行为特征,包含视频跟踪数据及特征提取结果,可用于研究ins-11基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- ins-11 (tm1053) on food R_2011_05_12__12_22_3586_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,由tierpsy软件提取,具体特征未详细说明
- ins-11 (tm1053) on food R_2011_05_12__12_22_3586.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,推测包含线虫行为的WCON格式数据(行为数据交换标准格式)
- ins-11 (tm1053) on food R_2011_05_12__12_22_3586.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为原始跟踪数据,如骨架分割信息(共26234个分割骨架)、时间参数(总时长898.967秒,帧率30.03帧/秒)、空间参数(像素对应微米数4.52754)等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ins-11(tm1053)II突变体与野生型线虫的行为差异,探究ins-11基因的功能
- 行为表型分析: 基于视频跟踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等表型特征
- 生物行为数据库补充: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,支持大规模线虫行为数据的整合分析
- 实验方法验证: 参考本实验的protocol(E. Yemini等人方法),验证线虫行为实验的标准化流程
- 基因与行为关联研究: 探索ins-11基因表达与线虫行为表型之间的关联机制