数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)QL188 ins-19(tm5155)品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含视频追踪数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于研究ins-19基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:ins-19 (tm5155) on food R_2012_09_27__15_22_13410.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含26545个分割骨架信息,对应实验总时长899.177秒、帧率30.7692帧/秒的视频记录
- 特征提取文件(.hdf5格式)
- 文件名称:ins-19 (tm5155) on food R_2012_09_27__15_22_13410_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含基于视频追踪的运动、形态等量化指标
- 标准化格式文件(.zip格式)
- 文件名称:ins-19 (tm5155) on food R_2012_09_27__15_22_13410.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon标准化格式的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析ins-19基因缺失(tm5155突变)对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 线虫行为学分析:基于视频追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、节律及反应特征
- 生物信息标准化:利用wcon格式文件开展跨数据库的线虫行为数据整合与比较
- 实验方法验证:参考实验方案(如30分钟适应期、追踪软件参数)优化线虫行为学实验设计