数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB946品系(基因型ric-19(ok833))成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年8月开展,通过视频追踪获取线虫在特定培养基上的运动行为特征,包含原始追踪数据、特征数据及标准化格式数据,共3个文件。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:ric-19 (ok833) on food L_2011_08_24__10_21_2262_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含基于视频追踪提取的运动参数(如骨架分段、速度、轨迹等)
- 原始追踪文件:
- 文件名称:ric-19 (ok833) on food L_2011_08_24__10_21_2262.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储视频追踪原始数据,包含每帧线虫的位置、形态等基础追踪信息
- 标准化行为数据文件:
- 文件名称:ric-19 (ok833) on food L_2011_08_24__10_21_2262.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:存储标准化的线虫行为数据,采用wcon格式记录运动行为的时间序列信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析ric-19基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 行为表型分析:基于视频追踪数据研究突变体线虫的行为模式差异
- 生物行为数据库补充:为线虫行为数据库提供标准化的基因功能实验数据
- 行为分析算法验证:可作为生物行为追踪算法(如tierpsy)的测试数据集