数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)IC683品系npr-9(tm1652)X基因的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基中的行为表现,包含视频追踪数据、特征提取结果及行为参数文件,是线虫行为学研究的基础实验数据。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:npr-9 (tm1652)X on food R_2010_01_22__12_12_3017.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为原始追踪数据,涉及视频帧率(25.51帧/秒)、像素分辨率(4.46935微米/像素)、总时长(899.13秒)及19581个分割骨架数据
- 特征数据文件
- 文件名称:npr-9 (tm1652)X on food R_2010_01_22__12_12_3017_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,涵盖运动轨迹、体态变化等量化指标
- 行为数据压缩包
- 文件名称:npr-9 (tm1652)X on food R_2010_01_22__12_12_3017.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的标准化格式文件,用于行为数据的跨平台共享与分析
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology William R Schafer实验室
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析npr-9基因对秀丽隐杆线虫行为模式的调控作用
- 分子神经生物学实验:探究神经递质受体基因与线虫摄食、运动行为的关联机制
- 行为学实验方法验证:基于E. Yemini等提出的实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 模式生物行为分析:为秀丽隐杆线虫行为表型的量化研究提供原始数据支持
- 生物信息学工具应用:测试tierpsy等行为追踪软件在线虫行为特征提取中的性能