数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫RB1380株(携带C11D2.2基因ok1565敲除等位基因)的行为实验数据,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基中的行为特征,包括运动轨迹、骨架数据等,实验由MRC分子生物学实验室完成,采用Tierpsy软件追踪分析。
文件详解
- 特征数据文件:
CIID2.2 (ok1565)IV on food R_2011_08_04__12_26_51___1___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含运动轨迹、速度、弯曲度等行为学特征参数
- 行为数据压缩文件:
CIID2.2 (ok1565)IV on food R_2011_08_04__12_26_51___1___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据的WCON格式文件,包含标准化的行为时间序列数据
- 主数据文件:
CIID2.2 (ok1565)IV on food R_2011_08_04__12_26_51___1___6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含26592个分段骨架数据、视频像素与微米映射关系(4.56571微米/像素)等基础数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析C11D2.2基因敲除对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为学特征分析:研究线虫在食物存在条件下的运动模式、觅食行为等特征
- 神经生物学研究:探索基因与行为表型之间的关联机制
- 实验方法验证:验证Tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为追踪中的应用效果
- 模式生物数据库补充:为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的实验数据支持