数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB2544 ins-4(ok3534)II品系线虫的行为实验数据。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,采用tierpsy软件追踪线虫行为,包含实验条件、视频参数及行为特征数据,共3个相关文件。
文件详解
- 文件1:Ins-4 (ok3534)II on food R_2011_06_07__10_37_2911_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,基于tierpsy软件提取的运动、姿态等特征
- 文件2:Ins-4 (ok3534)II on food R_2011_06_07__10_37_2911.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验原始追踪数据,记录线虫在视频中的位置、骨架等基础信息
- 文件3:Ins-4 (ok3534)II on food R_2011_06_07__10_37_2911.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,符合线虫行为数据交换标准
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析ins-4基因对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 行为学实验方法验证:参考实验方案(E. Yemini et al.方法)及tierpsy软件的应用效果
- 模式生物行为特征分析:基于视频追踪数据研究线虫在NGM培养基上的运动、觅食等行为
- 基因与行为关联分析:探索ins-4基因变异与线虫行为表型的相关性