数据集概述
本数据集为香鱼(Plecoglossus altivelis)种群遗传结构研究的相关数据,包含120个采样点的4746尾香鱼个体的12个微卫星标记基因型数据,以及用于AMOVA模拟分析的Perl脚本和说明文档,旨在通过密集位点采样解析该洄游性鱼类的细微遗传种群结构。
文件详解
- 文件名称:Microsatellite Genotypes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含4746尾香鱼个体(来自120个采样点)的12个微卫星标记基因型数据,涉及琉球亚种(Plecoglossus altivelis ryukyuensis)及日本-琉球群岛周边洄游型和陆封型指名亚种(P. a. altivelis)的遗传信息。
- 文件名称:custom Perl scripts.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于AMOVA模拟分析的自定义Perl脚本压缩包,用于评估密集位点采样对解析遗传种群结构的效果。
- 文件名称:README_for_custom Perl scripts.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供自定义Perl脚本的使用说明,包括运行generate_dataset6.sh脚本的参数设置、依赖软件(Arlequin 3.5命令行版本)及下载链接等信息。
数据来源
论文“Using dense locality sampling resolves the subtle genetic population structure of the dispersive fish species Plecoglossus altivelis”
适用场景
- 渔业资源管理: 解析香鱼种群的细微遗传结构,为其管理单元或保护单元的划分提供数据支持。
- 种群遗传学研究: 分析洄游型香鱼种群的遗传分化及地理分布模式,验证密集位点采样在解析洄游性物种遗传结构中的有效性。
- 微卫星标记应用: 利用12个微卫星标记的基因型数据,开展香鱼种群遗传多样性、基因流等相关研究。
- 生物信息学分析方法验证: 通过AMOVA模拟脚本,评估不同采样策略对遗传固定指数估算稳定性和可靠性的影响。