数据集概述
本数据集围绕线粒体 prohibitin 复合物结构的对称性争议展开,包含对相关研究的反驳分析数据、结构预测文件、原始数据及验证文件,支持对复合物不对称开放构象及更大结构的研究,强调低温电子断层扫描中对称性施加的谨慎性。
文件详解
该数据集包含11个文件,具体说明如下:
- 文档文件:
- README for Herrmann, Rose et al.txt:TXT格式,数据集说明文档,介绍各文件内容及研究背景
- 数据文件:
- KRT_MattersArising_Herrmann_final.xlsx:XLSX格式,关键资源数据文件
- Raw data.xlsx:XLSX格式,原始实验数据文件
- 结构预测与模型文件:
- AF3 heterododecamer prediction.cif:CIF格式,AlphaFold3预测的异源十二聚体prohibitin复合物模型
- AF3 heteroundecamer prediction.cif:CIF格式,AlphaFold3预测的异源十一聚体prohibitin复合物模型(用于对比)
- AF3 PHB heterododecamer prediction.zip:ZIP格式,异源十二聚体预测的压缩文件
- 密度图与映射文件:
- 9O6S_molmap_30A.mrc:MRC格式,9O6S结构30埃分辨率的分子映射文件
- 8RRH_molmap_30A.mrc:MRC格式,8RRH结构30埃分辨率的分子映射文件
- Maps.zip:ZIP格式,密度图压缩文件
- 分析与验证文件:
- PHB xlink comparison.prism:PRISM格式,prohibitin交联数据对比文件
- PyTOM template match assessmnet.prism:PRISM格式,PyTOM模板匹配评估文件
适用场景
- 结构生物学研究:分析线粒体prohibitin复合物的真实构象及对称性问题
- 低温电子断层扫描方法学研究:验证低分辨率下对称性施加的合理性
- 蛋白质复合物结构预测验证:对比不同预测模型与实验数据的一致性
- 交联质谱数据分析:重新分析prohibitin复合物的交联质谱数据以支持结构模型