小蜂总科转录组序列系统发育分析补充数据集

数据集概述

本数据集为小蜂总科(膜翅目:小蜂总科)转录组序列系统发育研究的补充数据,包含单基因比对、串联超级矩阵、分区文件及系统发育树等文件,支持探究其快速辐射、趋同演化及进化成功的历史。

文件详解

该数据集包含3个压缩文件,对应不同类型的系统发育分析数据: - 1_single_gene_alignments.zip:压缩文件,包含经过比对优化的直系同源基因多序列比对数据,涵盖氨基酸和核苷酸序列 - 2_datasets_and_partitionfiles.zip:压缩文件,包含经Aliscore和Mare处理后的串联超级矩阵(phylip格式,按clan、Pfam-A、Pfam-B及无效数据块重排)、PartitionFinder分析结果(RAxML分区文件格式的最佳分区方案) - 3_tree_files.zip:压缩文件,包含不同数据集的Newick格式系统发育树文件、Nexus格式的时间校准树文件

适用场景

  • 昆虫系统发育研究:分析小蜂总科的演化关系、快速辐射及趋同演化机制
  • 分子进化分析:基于转录组序列数据探究基因序列与物种进化的关联
  • 系统发育方法验证:测试不同数据分区方案对小蜂总科系统发育树构建的影响
  • 进化生物学教学:作为分子系统发育分析的实践案例数据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 178.8 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
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