数据集概述
该数据集包含针对小分子靶向招募核糖核酸酶降解c9ALS/FTD r(G4C2)重复扩增的RNA-seq实验数据,涵盖患者来源iPSC、健康供体iPSC、PWR500小鼠及患者来源iPSN四种样本类型,用于评估化合物对转录组的影响。
文件详解
- 文件名称:SET1 ALS iPSC Sequencing.xlsx
- 文件格式:Excel(.xlsx)
- 内容说明:c9ALS患者来源iPSC经50 nM化合物7处理后的RNA-seq分析数据,包含平均Log2( Fold Change)与-Log10(q-value)的关联分析,基于编码SNP计算含重复扩增的突变等位基因丰度,样本为1个C9orf72 iPSC系,每系3个重复
- 文件名称:SET2 Healthy iPSC Sequencing.xlsx
- 文件格式:Excel(.xlsx)
- 内容说明:健康供体iPSC经50 nM化合物7处理后的RNA-seq分析数据,包含平均Log2( Fold Change)与-Log10(q-value)的关联分析,基于编码SNP计算含重复扩增的突变等位基因丰度,样本为1个C9orf72 iPSC系,每系3个重复
- 文件名称:SET3 PWR500 Sequencing.xlsx
- 文件格式:Excel(.xlsx)
- 内容说明:+/+PWR500小鼠经33 nmol化合物7处理后的RNA-seq分析数据,基于编码SNP计算含重复扩增的突变等位基因丰度,样本为每组3只小鼠
- 文件名称:SET4 Neuron Sequencing.xlsx
- 文件格式:Excel(.xlsx)
- 内容说明:c9ALS患者来源iPSN经50 nM化合物7处理后的RNA-seq分析数据,包含平均Log10(TPM)值,基于编码SNP计算含重复扩增的突变等位基因丰度,样本为1个C9orf72 iPSN系,每系3个重复
适用场景
- 神经退行性疾病机制研究:分析c9ALS/FTD相关r(G4C2)重复扩增的降解效果
- 小分子药物研发:评估靶向核糖核酸酶招募化合物对转录组的影响
- 疾病模型验证:比较患者来源细胞与动物模型对药物的响应差异
- 基因表达调控分析:研究化合物处理后不同样本类型的基因表达变化规律