新冠病毒SARS-CoV-2感染宿主细胞双RNA测序数据集
数据来源:互联网公开数据
标签:SARS-CoV-2,新冠病毒,双RNA测序,转录组学,宿主-病原体互作,基因表达,机器学习
数据概述:
本数据集包含通过双RNA测序技术获得的关于新冠病毒(SARS-CoV-2)感染宿主细胞的转录组数据。双RNA测序是一种同时分析病原体及其宿主细胞转录组的方法,能够深入揭示病原体与宿主细胞之间的相互作用。
数据集包含两个主要文件:
- Dual_F20_QN.csv:经过20%过滤和分位数标准化处理后的数据。
 
- Dual_RNA_Seq.csv:原始计数表格。
 
在上述两个文件中,最后12行为病毒(SARS-CoV-2)的转录本,包括:ORF1a, ORF1ab, S, ORF3a, E, M, ORF6, ORF7a, ORF7b, ORF8, N, ORF10。其余行为宿主细胞的转录本。
数据用途概述:
该数据集适用于研究新冠病毒与宿主细胞之间的互作关系,以及基因表达调控机制。研究人员可以使用机器学习方法探索宿主与病毒转录本之间的关联,从而深入理解病毒感染机制、宿主免疫反应,并为抗病毒药物的研发提供潜在靶点。此外,该数据集也可用于生物信息学教学和科研,例如转录组数据分析、差异基因表达分析等。