数据集概述
该数据集包含对雌性Casp1(fl/fl) Aldh1l1-CreERT2(+/-)小鼠及Casp1(fl/fl)同窝对照小鼠(每组3只)的海马组织混合样本进行的单细胞RNA测序数据,旨在研究星形胶质细胞炎症小体信号对海马可塑性的调节作用。
文件详解
数据集包含12个.gz格式压缩文件,具体说明如下:
- 对照样本(Control)相关文件:
- ctrl_filtered_feature_bc_matrix.barcodes.tsv.gz:过滤后的特征- barcode矩阵的条形码文件
- ctrl_filtered_feature_bc_matrix.matrix.mtx.gz:过滤后的特征- barcode矩阵的表达量文件
- ctrl_filtered_feature_bc_matrix.features.tsv.gz:过滤后的特征- barcode矩阵的特征文件
- ctrl_raw_feature_bc_matrix.barcodes.tsv.gz:原始特征- barcode矩阵的条形码文件
- ctrl_raw_feature_bc_matrix.matrix.mtx.gz:原始特征- barcode矩阵的表达量文件
- 敲除样本(KOAst,标记为tx)相关文件:
- tx_filtered_feature_bc_matrix.barcodes.tsv.gz:过滤后的特征- barcode矩阵的条形码文件
- tx_filtered_feature_bc_matrix.matrix.mtx.gz:过滤后的特征- barcode矩阵的表达量文件
- tx_raw_feature_bc_matrix.features.tsv.gz:原始特征- barcode矩阵的特征文件
适用场景
- 神经科学研究:分析星形胶质细胞炎症小体信号对海马可塑性的分子调控机制
- 单细胞转录组学分析:探究Casp1基因敲除对小鼠海马星形胶质细胞基因表达谱的影响
- 神经炎症研究:揭示炎症小体信号通路在海马组织中的作用及与神经可塑性的关联
- 生物信息学方法应用:基于单细胞RNA测序数据挖掘星形胶质细胞特异性基因表达特征