数据集概述
本数据集包含基于分子和形态学数据的新热带区木材降解甲虫(鞘翅目:黑蜣科)帕萨利尼族系统发育分析相关文件,涵盖分析输入矩阵、配置文件、日志及输出结果,为该类群的系统发育研究提供数据支持。
文件详解
该数据集包含二十两个系统发育分析相关文件,具体说明如下:
- 输入与配置文件:
- MAFFT_Combine_MrBayes_VII192022.nex:MrBayes分析输入文件,可能包含序列比对数据与分析参数配置
- Trees_Parsimony_TNT.nex:TNT简约法分析输入文件,包含用于简约法分析的树数据
- 输出与结果文件:
- MAFFT_Combine_MrBayes_VII192022.nex.con.tre:MrBayes分析的一致树文件,记录系统发育关系的共识结果
- MAFFT_Combine_MrBayes_VII192022.nex.con.tre.pdf:一致树的PDF格式文件,便于可视化查看
- Output_TNT_Parsimony.out:TNT简约法分析的输出日志文件,记录分析过程与结果
- Strict_Consensus_Parsominy.emf:简约法分析的严格一致树文件,记录简约法得到的共识树
- 分析过程文件:
- MAFFT_Combine_MrBayes_VII192022.nex.run1.p、MAFFT_Combine_MrBayes_VII192022.nex.run2.p等.p格式文件:MrBayes分析的参数文件,记录分析过程中的参数设置
- MAFFT_Combine_MrBayes_VII192022.nex.run1.t、MAFFT_Combine_MrBayes_VII192022.nex.run2.t等.t格式文件:MrBayes分析的树文件,记录分析过程中生成的树结构
- MAFFT_Combine_MrBayes_VII192022.nex.mcmc:MrBayes分析的MCMC过程文件,记录马尔可夫链蒙特卡罗分析的过程数据
- MAFFT_Combine_MrBayes_VII192022.nex.trprobs:MrBayes分析的树概率文件,记录各树结构的概率信息
适用场景
- 昆虫系统发育研究:用于分析新热带区帕萨利尼族木材降解甲虫的系统发育关系
- 生物多样性研究:支持新热带区昆虫多样性与演化历史的相关分析
- 分子系统学方法验证:可用于验证MrBayes、TNT等系统发育分析方法的应用效果
- 形态与分子数据整合分析:为整合形态学与分子数据进行系统发育研究提供案例数据