新世界鼠尾草系统发育基因组矩阵与分区文件数据集

数据集概述

本数据集包含一篇关于新世界鼠尾草(Salvia subgenus Calosphace)植物锚定杂交富集方法试点研究的系统发育基因组数据,涵盖未过滤和过滤的矩阵文件及分区文件,还包括用于数据过滤的R脚本,共十六个文件,存储于一个目录下。

文件详解

该数据集包含一个目录及其中的文件,具体说明如下: - 主目录: Phylogenomic matrices and partition files from A pilot study applying the plant Anchored Hybrid Enrichment method to New World sages (Salvia subgenus Calosphace; Lamiaceae)/ - 系统发育基因组矩阵文件(.phy格式,共十五个): - 过滤数据集文件: 如Calosphace_Filtered_dataset_SR_5_448Partitions.phy、Calosphace_Filtered_dataset_SR_10_448Partitions.phy等,包含不同过滤条件下的系统发育基因组矩阵与分区信息 - 未过滤数据集文件: 推测包含未经过滤的原始系统发育基因组矩阵数据 - 代码文件(.R格式,共一个): - Supplementary_data_1_Script.R: 用于过滤数据集的R脚本文件

适用场景

  • 植物系统发育研究: 用于分析新世界鼠尾草(Salvia subgenus Calosphace)的系统发育关系
  • 基因组数据分析方法验证: 可验证植物锚定杂交富集方法在系统发育研究中的应用效果
  • 生物信息学方法研究: 用于测试和比较不同数据过滤策略对系统发育分析结果的影响
  • 植物分类学研究: 为新世界鼠尾草的分类学研究提供基因组层面的数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.56 MiB
最后更新 2025年11月30日
创建于 2025年11月30日
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