数据集概述
本数据集为新型正交CRISPR/Cas9可编程转录激活因子相关研究的支撑数据,包含实验方法、图表、表格等材料,聚焦植物基因激活的全基因组特异性分析,为相关生物学研究提供数据支持。
文件详解
- 文档类文件(共10个PDF格式文件):
- METHODS.pdf:实验方法详细说明文档
- Figure S1 gRNA design and assembly.pdf:gRNA设计与组装示意图
- Figure S2 Comparison of scRNA gRNA 2.0 and 2.1 using dCas9EDLL-MS2VPR targeting the pNos promoter..pdf:不同版本scRNA gRNA靶向pNos启动子的效果对比图
- Table S1 List of generated GB level 0 parts and gRNAs.pdf:生成的GB 0级元件与gRNA列表
- Table S2 GB level -1 parts for multiplexing strategy.pdf:用于多重策略的GB -1级元件列表
- Table S4 GB TUs and Modules..pdf:GB转录单元与模块列表
- Table S5 Protospacer sequence and position design for each promoter.pdf:各启动子的原型间隔序列及位置设计表
- Table S7 Potential off-targets of gRNAs used for NbDFR and NbAN2 dCas9EV2.1 activation..pdf:gRNA潜在脱靶位点分析表
- 数据类文件(共1个XLSX格式文件):
- Table S8 GO terms analysis.xlsx:基因本体(GO)术语分析数据文件
适用场景
- 植物基因工程研究:分析CRISPR/Cas9转录激活系统对植物基因的激活效率
- 基因编辑特异性研究:探究gRNA的潜在脱靶效应及全基因组特异性
- 分子生物学实验设计:参考gRNA设计、元件组装及多重策略的实验方案
- 基因功能注释分析:利用GO术语分析数据研究基因功能分类与富集情况