数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了trpa-2(tm3092)I基因突变体(FX3092菌株)的行为实验数据。实验于2010年7月6日开展,包含成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基、OP50食物条件下的行为记录,涉及视频采集参数、行为特征提取等信息,共3个相关文件。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:M05B5.6 (tm3092) on food L_2010_07_06__10_28_0682_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据(如骨架分段、运动参数等),具体字段基于软件功能涵盖行为轨迹、运动速度、身体弯曲度等特征。
- 原始/处理数据文件
- 文件名称:M05B5.6 (tm3092) on food L_2010_07_06__10_28_0682.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测存储实验的原始或核心处理数据,可能包含视频帧对应的线虫行为原始记录、基础定位信息等。
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:M05B5.6 (tm3092) on food L_2010_07_06__10_28_0682.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含wcon格式的线虫行为数据文件,wcon格式通常用于存储线虫连续行为轨迹及相关参数。
数据来源
movement.openworm.org(秀丽隐杆线虫行为数据库)
适用场景
- 线虫基因突变体行为分析:研究trpa-2基因对秀丽隐杆线虫运动模式、觅食行为等的影响。
- 分子生物学实验验证:验证trpa-2(tm3092)I突变体的表型特征,支持基因功能研究。
- 行为学实验方法参考:借鉴实验的培养条件、记录协议,指导同类线虫行为实验设计。
- 线虫行为数据标准化研究:基于wcon格式数据,探索线虫行为数据的标准化存储与共享方式。