数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)AQ2932菌株的行为实验记录,包含实验条件、视频参数及行为分析文件。实验由MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪线虫行为,记录总时长约九百秒,用于研究特定基因突变株的行为特征。
文件详解
- 文件名称:
nca-1 (gk9) nca-2 (gk5) nRHO-1 QT309 on food L_2011_11_10__11_57_39___6___6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测为原始行为追踪数据,包含线虫运动的时空坐标等基础信息
- 文件名称:
nca-1 (gk9) nca-2 (gk5) nRHO-1 QT309 on food L_2011_11_10__11_57_39___6___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测为行为特征提取数据,包含线虫运动速度、弯曲度等分析指标
- 文件名称:
nca-1 (gk9) nca-2 (gk5) nRHO-1 QT309 on food L_2011_11_10__11_57_39___6___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,推测包含线虫行为的标准化格式数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析nca-2、unc-77基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为追踪的标准化流程
- 模式生物行为分析: 研究秀丽隐杆线虫在特定培养基(NGM低蛋白胨琼脂)和食物(OP50)条件下的行为模式
- 生物信息学工具应用: 测试tierpsy软件在模式生物行为数据处理中的性能与效果