数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了CB1141品系(携带cat-4基因e1141等位突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年7月23日在英国MRC分子生物学实验室开展,使用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,通过tierpsy软件追踪线虫运动行为,包含原始视频衍生数据和特征分析结果。
文件详解
- 主数据文件
- 文件名称:cat-4 (e1141)I on food L_2010_07_23__10_3532.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含21492个分割骨骼数据、每秒24.0385帧的视频采样信息,以及视频像素与实际长度的映射(4.53292微米/像素)
- 特征数据文件
- 文件名称:cat-4 (e1141)I on food L_2010_07_23__10_3532_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:基于原始追踪数据提取的行为特征数据,用于分析线虫的运动模式、轨迹特征等行为指标
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:cat-4 (e1141)I on food L_2010_07_23__10_3532.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的wcon格式文件压缩包,wcon格式用于标准化存储线虫行为追踪数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析cat-4基因e1141突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 生物行为学分析:研究成年雌雄同体线虫在特定培养基和食物源条件下的运动特征
- 实验方法验证:基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为追踪技术的重复性和可靠性
- 行为数据标准化研究:利用wcon格式数据探索线虫行为数据的标准化存储与共享规范
- 神经生物学研究:结合基因背景分析线虫行为与神经系统功能的关联