数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了CB1141 cat-4(e1141)V品系成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基上进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频处理后的特征数据、原始追踪数据及wcon格式压缩文件,可用于线虫行为表型的遗传学研究。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:cat-4 (e1141)I on food L_2010_07_22__13_08_30__7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪提取的特征数据,具体字段未详细说明,推测涵盖运动轨迹、身体姿态、行为模式等量化特征。
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:cat-4 (e1141)I on food L_2010_07_22__13_08_30__7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始追踪数据,推测涵盖时间序列的位置坐标、运动参数等基础数据。
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:cat-4 (e1141)I on food L_2010_07_22__13_08_30__7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:wcon格式为线虫行为数据交换格式,压缩包内包含标准化的行为数据记录。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学行为研究: 分析cat-4基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为、觅食模式等表型的影响。
- 神经生物学机制探索: 结合基因背景与行为特征,研究神经递质(如生物胺)调控线虫行为的分子机制。
- 行为分析软件验证: 基于已知品系的行为数据,验证tierpsy等行为追踪软件的准确性与可靠性。
- 模式生物标准化实验参考: 为秀丽隐杆线虫行为实验提供标准化的实验条件(培养基、追踪参数等)参考。