数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,记录了JR2370菌株(egl-18(ok290)IV基因突变体)的成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据,包含视频分析得到的运动特征、骨架数据等内容,可用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:egl-18 (ok290)IV on food L_2010_07_20__11_2434.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含实验相关的WCON格式压缩文件,可能记录线虫行为的原始或结构化运动数据
- 文件名称:egl-18 (ok290)IV on food L_2010_07_20__11_2434_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,可能包含运动轨迹、速度、弯曲度等特征指标
- 文件名称:egl-18 (ok290)IV on food L_2010_07_20__11_2434.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的核心数据,可能包含视频帧对应的线虫骨架数据(共18601个分段骨架)、时间戳等基础信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变功能研究: 分析egl-18(ok290)IV基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 线虫行为特征提取与分析: 基于HDF5文件中的特征数据,研究线虫的运动模式、速度变化等行为规律
- 生物实验数据标准化研究: 参考该实验的protocol和数据格式,优化秀丽隐杆线虫行为实验的数据采集与存储标准
- 模式生物行为数据库补充: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合与比较分析