数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫LX982品系(携带ocr-1、ocr-2、ocr-4基因突变)的行为实验记录,属于C.elegans behavioural database的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为,包含实验设计参数、视频追踪数据及特征提取结果,共3个数据文件。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:ocr-4 (vs137); ocr-2 (9447); ocr-1 (ok134) on food L_2010_06_15__10_45_5722_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动行为的特征提取数据,基于tierpsy软件分析结果
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:ocr-4 (vs137); ocr-2 (9447); ocr-1 (ok134) on food L_2010_06_15__10_45_5722.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,格式为wcon
- 核心行为数据文件
- 文件名称:ocr-4 (vs137); ocr-2 (9447); ocr-1 (ok134) on food L_2010_06_15__10_45_5722.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的基础行为数据,如分段骨骼数据(共17860个)、时间参数等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究: 分析ocr基因家族突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 模式生物行为特征分析: 研究成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动模式
- 行为实验方法验证: 基于E. Yemini等提出的实验方法,验证线虫行为追踪技术的可靠性
- 生物信息学工具应用: 评估tierpsy软件在模式生物行为特征提取中的效果