数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了CB109株系(unc-16(e109)III基因突变)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中的行为实验数据,包含实验条件、视频参数及分析生成的文件,用于线虫行为学研究。
文件详解
- 行为数据文件
- 文件名称:
unc-16 (e109) on food R_2009_12_10__11_42___3___5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,包含行为轨迹、骨架信息等原始或结构化数据
- 特征数据文件
- 文件名称:
unc-16 (e109) on food R_2009_12_10__11_42___3___5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件分析生成的行为特征数据,包含线虫运动、姿态等量化特征
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:
unc-16 (e109) on food R_2009_12_10__11_42___3___5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,格式为wcon(线虫行为数据标准格式)
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变行为表型分析:研究unc-16基因突变对秀丽隐杆线虫运动、觅食等行为的影响
- 模式生物行为学方法验证:基于已发表的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性与标准化
- 线虫行为特征提取算法测试:利用数据集评估tierpsy等软件提取行为特征的准确性与效率
- 神经发育相关基因功能研究:通过行为数据关联unc-16基因在神经调控中的作用机制