数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫VC125 tyra-3(ok325)X品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为特征,包含视频追踪数据、骨架分割及特征提取结果,可用于线虫基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 文件名称:tyra-3 (ok325)X on food L_2010_01_28__14_45_10810.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的wcon格式压缩文件,记录线虫运动的时空坐标等原始追踪数据
- 文件名称:tyra-3 (ok325)X on food L_2010_01_28__14_45_10810.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,包含18810个分段骨架信息,对应总时长898.979秒、帧率25.7069帧/秒的视频追踪结果
- 文件名称:tyra-3 (ok325)X on food L_2010_01_28__14_45_10810_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含基于视频像素(4.55526微米/像素)转换的运动特征参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析tyra-3基因(ok325等位基因)对秀丽隐杆线虫行为表型的调控作用
- 行为遗传学分析:关联线虫基因型与运动、摄食等行为特征的定量关系
- 实验方法验证:基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性与标准化流程
- 行为分析工具评估:测试tierpsy软件在线虫行为追踪与特征提取中的性能与准确性