数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2010年8月开展的MT1236品系(egl-40(n606)IV突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM培养基中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频数据、特征数据和骨架分割数据,可用于研究egl-40基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:egl-40 (n606)IV on food L_2010_08_05__12_06_1465.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含秀丽隐杆线虫行为实验的原始或结构化行为数据,具体字段需解压后查看
- 特征数据文件
- 文件名称:egl-40 (n606)IV on food L_2010_08_05__12_06_1465_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验中线虫行为特征数据,具体特征字段由tierpsy软件生成
- 行为追踪数据文件
- 文件名称:egl-40 (n606)IV on food L_2010_08_05__12_06_1465.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,包括26997个分割骨架数据,帧率为每秒30.03帧,视频像素对应实际长度为4.45817微米/像素
数据来源
C. elegans behavioural database
适用场景
- 基因功能研究:分析egl-40基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 模式生物行为学分析:基于线虫行为特征数据,研究其运动模式、觅食行为等表型
- 神经生物学实验:结合基因背景与行为数据,探究神经调控机制
- 行为追踪算法验证:利用标准化实验数据验证线虫行为追踪软件的准确性