数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,记录了CB4852野生型线虫(英国Rothamsted分离株N3)的行为实验数据。实验于2011年3月开展,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,通过Tierpsy软件追踪线虫行为,包含原始追踪数据、特征提取数据及标准化格式文件。
文件详解
- 核心数据文件(Scientific files)
- 文件名称:
135 CB4852 on food L_2011_03_28__12_44_32___6___3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为追踪原始数据,包含时间序列的运动轨迹、骨架 segmentation 信息等基础观测数据
- 文件名称:
135 CB4852 on food L_2011_03_28__12_44_32___6___3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:提取的线虫行为特征数据,基于原始追踪数据计算的运动参数、姿态特征等分析指标
- 标准化格式文件(Archive files)
- 文件名称:
135 CB4852 on food L_2011_03_28__12_44_32___6___3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含WCON格式文件)
- 字段映射介绍:采用WCON标准化格式存储的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C. elegans behavioural database(线虫行为数据库)
适用场景
- 线虫行为表型分析:研究CB4852野生型线虫在食物源存在下的运动模式、探索行为等表型特征
- 神经生物学研究:结合行为数据探究线虫神经回路与行为调控机制
- 实验方法验证:验证Tierpsy追踪软件在线虫行为实验中的应用效果与数据可靠性
- 生物信息学分析:基于标准化WCON格式数据开展跨实验、跨菌株的行为数据整合研究
- 环境因素影响研究:分析培养基成分、食物源对秀丽隐杆线虫行为的调控作用