数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT1073 pkg-1(n478)IV品系线虫的行为实验数据。实验于2010年5月开展,包含线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为视频分析结果,涉及实验条件、线虫品系、基因信息及行为特征数据,共3个文件。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:
egl-4 (n478)IV on food R_2010_05_11__17_30_17___4___17.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为视频的原始或基础分析数据,如视频帧、线虫骨架数据等(具体字段未明确说明)
- 文件名称:
egl-4 (n478)IV on food R_2010_05_11__17_30_17___4___17_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为特征数据,如运动轨迹、速度、弯曲度等(具体字段未明确说明)
- 文件名称:
egl-4 (n478)IV on food R_2010_05_11__17_30_17___4___17.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:推测为线虫行为数据的标准化格式文件,可能包含时间序列的行为参数(具体字段未明确说明)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析pkg-1(n478)基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 线虫行为学分析: 基于视频特征数据研究线虫在食物环境中的运动模式、行为节律等
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性
- 生物信息学工具应用: 测试或应用tierpsy软件进行线虫行为视频的分析与特征提取