数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了VC1309品系(携带nlp-8基因ok1799突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,通过视频跟踪获取线虫运动特征,包含行为轨迹、骨架分割等数据,可用于研究nlp-8基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:
nlp-8 (ok1799)I on food R_2010_03_17__11_35_07___1___6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,可能包含原始视频帧、行为轨迹坐标等基础观测信息
- 文件名称:
nlp-8 (ok1799)I on food R_2010_03_17__11_35_07___1___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为WCON格式行为数据文件,通常包含线虫运动的时间序列、位置、姿态等标准化行为记录
- 文件名称:
nlp-8 (ok1799)I on food R_2010_03_17__11_35_07___1___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,包含19734个分割骨架数据,可能涵盖运动速度、弯曲度、身体姿态等特征指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-8基因ok1799突变对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的调控作用
- 行为遗传学实验验证: 验证特定基因缺陷线虫的行为表型差异,支持基因-行为关联分析
- 模式生物行为分析: 基于标准化行为数据,开展秀丽隐杆线虫行为模式的定量研究
- 生物行为特征提取算法测试: 利用标注的骨架数据和特征文件,优化线虫行为特征提取模型