数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了npr-10(tm1568)X品系成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为实验数据。实验由Laura Grundy执行,采用tierpsy软件追踪,包含原始视频衍生的骨架数据、特征数据及标准化格式文件,可用于分析该基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:
npr-10 (tm1568)X on food R_2010_01_26__16_15_20___1___12.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为的原始追踪数据,如骨架坐标、运动轨迹等基础观测信息
- 文件名称:
npr-10 (tm1568)X on food R_2010_01_26__16_15_20___1___12_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含提取的线虫行为特征数据,如运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等量化指标
- 文件名称:
npr-10 (tm1568)X on food R_2010_01_26__16_15_20___1___12.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的压缩文件,推测为线虫行为数据的标准化交换格式文件
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析npr-10基因对秀丽隐杆线虫运动行为、觅食策略等表型的调控作用
- 神经生物学实验验证: 验证npr-10基因在调控线虫行为中的分子机制
- 行为学实验方法优化: 参考实验方案(如30分钟适应期、tierpsy软件追踪)改进线虫行为实验设计
- 生物数据标准化应用: 基于wcon格式文件探索线虫行为数据的跨平台共享与整合