数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了AQ2153品系(npr-13(tm1504)V等位基因)成虫在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中的行为实验数据,包含实验条件、视频参数及行为特征文件,可用于分析该基因相关的线虫行为表型。
文件详解
- 文件1:
npr-13 (tm1504)V on food R_2010_01_22__11_54_23___4___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动、形态等行为特征指标
- 文件2:
npr-13 (tm1504)V on food R_2010_01_22__11_54_23___4___6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,可能包含原始视频解析后的线虫坐标、骨架信息等基础数据
- 文件3:
npr-13 (tm1504)V on food R_2010_01_22__11_54_23___4___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式文件,可能存储线虫行为的标准化运动轨迹数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析npr-13基因对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 行为学实验方法验证:参考实验方案(如30分钟适应期、视频录制参数)优化线虫行为实验设计
- 行为特征提取工具评估:基于tierpsy软件提取的特征数据,验证该工具在线虫行为分析中的应用效果
- 线虫行为数据库补充:作为公共线虫行为数据库的组成部分,支持多品系行为数据的对比分析