数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了QL53 ins-16(ok2919)菌株的行为实验数据。实验于2012年10月23日开展,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,通过Tierpsy软件追踪线虫运动,包含视频及处理后的特征数据,可用于研究ins-16基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件1:
ins-16 (ok2919) on food R_2012_10_23__13_27_26___7___13.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含实验原始视频数据的压缩文件,记录线虫行为的动态影像信息
- 文件2:
ins-16 (ok2919) on food R_2012_10_23__13_27_26___7___13_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含运动轨迹、骨架分段等处理后的特征信息
- 文件3:
ins-16 (ok2919) on food R_2012_10_23__13_27_26___7___13.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验基础数据,如视频帧率(30.03帧/秒)、像素微米比(4.15398微米/像素)、总时长(899.0秒)、分段骨架数量(26911个)等元数据及原始追踪结果
数据来源
C. elegans behavioural database
适用场景
- 基因功能研究:分析ins-16基因缺失(ok2919突变)对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 线虫行为学分析:基于追踪数据研究线虫在食物源环境中的运动模式、速度及轨迹特征
- 模式生物实验方法验证:参考实验设计(如培养基选择、追踪软件应用)优化秀丽隐杆线虫行为实验流程
- 生物信息学工具评估:以Tierpsy软件处理结果为例,验证行为追踪工具的准确性与可靠性