数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1374品系(ocr-3(ok1559)X基因突变)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据,包含视频追踪处理后的特征文件、行为数据压缩包等,用于研究该基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 实验特征文件
- 文件名称:ocr-3 (21537) on food R_2010_04_21__14_20_52__8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的19083个分段骨架等行为特征信息
- 行为数据压缩包
- 文件名称:ocr-3 (21537) on food R_2010_04_21__14_20_52__8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据文件(wcon格式),包含线虫运动轨迹、姿态等行为记录
- 实验数据文件
- 文件名称:ocr-3 (21537) on food R_2010_04_21__14_20_52__8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验基础数据,关联视频参数(如帧率32.1543帧/秒、像素对应微米数4.3011)、总时长897.328秒等元信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析ocr-3基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 生物行为学实验验证:验证特定基因缺陷线虫的运动、摄食等行为特征
- 行为数据分析方法开发:基于tierpsy软件提取的特征数据,开发线虫行为量化分析模型
- 神经生物学机制研究:结合基因背景与行为数据,探究线虫行为调控的分子机制