数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了MT2611菌株(携带unc-8基因n491n1192等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM培养基中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含线虫运动的特征数据、行为记录等文件,用于研究unc-8基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:
unc-8 rev on food L_2010_03_30__12_49_16___8___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪提取的特征数据,可能涉及运动轨迹、身体姿态、速度等行为特征指标
- 行为记录压缩文件
- 文件名称:
unc-8 rev on food L_2010_03_30__12_49_16___8___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为原始记录文件,wcon格式通常用于记录生物行为时间序列数据
- 追踪数据文件
- 文件名称:
unc-8 rev on food L_2010_03_30__12_49_16___8___6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始或处理后数据,可能涉及骨架分段信息(共19416个分段骨架)、时间戳等基础追踪数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析unc-8基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制
- 神经生物学实验验证: 验证unc-8基因相关神经通路与行为表型的关联
- 线虫行为学数据分析: 利用追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、速度变化等行为特征
- 生物信息学工具应用: 基于tierpsy软件分析结果,探索线虫行为特征提取与分析的方法优化
- 模式生物实验复现: 为其他线虫基因功能实验提供标准化行为实验的参考模板