数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)NL793 gpa-9(pk438)V品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包括运动轨迹、骨架数据等,通过专业软件采集和分析,为研究该基因相关的行为机制提供数据支持。
文件详解
- GPA-9 9PK438)v on food r_2010_03_09__11_07_0082_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,可能涉及运动轨迹、速度、身体弯曲度等由tierpsy软件提取的特征参数
- GPA-9 9PK438)v on food r_2010_03_09__11_07_0082.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为线虫行为数据交换格式(wcon)文件,记录线虫运动的时间序列数据
- GPA-9 9PK438)v on food r_2010_03_09__11_07_0082.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含原始或处理后的线虫行为数据,可能涉及骨架 segmentation 数据(共19628个分割骨架)、视频帧对应信息等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析gpa-9基因对NL793品系线虫行为的影响,探究基因与行为表型的关联
- 模式生物行为学分析:利用运动特征数据研究线虫在特定培养条件下的行为模式和规律
- 生物信息学算法验证:作为tierpsy软件分析结果的验证数据,评估行为特征提取算法的准确性
- 神经生物学机制研究:结合基因背景和行为数据,推测该基因在神经调控中的作用机制