数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB738 snf-4(ok496)II品系成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中进行,经30分钟适应后录制,包含行为特征、运动轨迹等分析结果,支持线虫基因功能与行为关联研究。
文件详解
- 文件名称:
snf-4 (ok496)II on food R_2009_11_18__13_11_49___6___9_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动特征参数(基于19353个分割骨架)
- 文件名称:
snf-4 (ok496)II on food R_2009_11_18__13_11_49___6___9.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储线虫运动轨迹数据,wcon格式为线虫行为数据标准格式
- 文件名称:
snf-4 (ok496)II on food R_2009_11_18__13_11_49___6___9.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始或处理后的核心数据,包含视频帧对应行为记录(视频帧率25.7732帧/秒,像素分辨率4.50623微米/像素,总时长898.88秒)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析snf-4(ok496)基因突变对秀丽隐杆线虫摄食、运动等行为的影响
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等的实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 神经生物学机制分析: 关联snf-4基因与线虫行为调控通路,探究分子机制
- 行为数据分析工具测试: 作为tierpsy等线虫行为分析软件的验证数据集,优化特征提取算法