数据集概述
本数据集包含支持蜥蜴与 Schellackia 寄生虫宿主-寄生虫共物种形成分子证据研究的相关数据。核心内容为西班牙蜥蜴中分离的 Schellackia 单倍型系统发育分析数据(含系统发育树)及 Schellackia 单倍型与蜥蜴宿主的协同系统发育分析数据,助力相关生物进化研究。
文件详解
该数据集包含两个目录下的文件,具体说明如下:
- 系统发育分析文件(位于 Phylogeny of Schellackia/ 目录下):
- Alignment_TCS_weighted.fas:FAS 格式文件,可能为 Schellackia 单倍型的 TCS 加权序列比对数据
- Alignment_MSAProbs.phy:PHY 格式文件,可能为 MSAProbs 方法生成的序列比对数据
- Bayesian_Tree_haplotypes.tre:TRE 格式文件,贝叶斯方法构建的 Schellackia 单倍型系统发育树
- ML_Tree_haplotypes.txt:TXT 格式文件,最大似然法构建的 Schellackia 单倍型系统发育树,包含分类单元标签及对应名称
- 协同系统发育分析文件(位于 Cophylogenetic analyses/ 目录下):
- Schellackia_distance_matrix.txt:TXT 格式文件,Schellackia 单倍型的距离矩阵数据
- Lacertid_distance_matrix.txt:TXT 格式文件,蜥蜴宿主的距离矩阵数据
- Lacertid_Manual_tree.txt:TXT 格式文件,人工构建的蜥蜴宿主系统发育树
- Associations.txt:TXT 格式文件,可能为 Schellackia 与蜥蜴宿主的关联数据
- Schellackia_Manual_tree.txt:TXT 格式文件,人工构建的 Schellackia 单倍型系统发育树
- treemap.nex.txt:TXT 格式文件,可能为用于展示系统发育关联的 treemap 数据
适用场景
- 寄生虫学研究:分析 Schellackia 寄生虫的系统发育关系及进化模式
- 宿主-寄生虫协同进化研究:基于共系统发育分析数据探究蜥蜴与 Schellackia 的共物种形成机制
- 分子生物学研究:利用序列比对和系统发育树数据开展相关基因进化分析
- 生物多样性研究:辅助理解蜥蜴宿主与寄生虫之间的生态关联及进化历史