数据集概述
本数据集为中国长豇豆(Vigna unguiculata ssp. sesquipedialis)种质资源的全基因组连锁不平衡研究原始数据,包含99份长豇豆及普通豇豆材料的1127个EST-SNP标记基因分型结果,用于分析其遗传多样性、群体结构及LD模式,为长豇豆驯化历史研究和全基因组关联分析提供数据支持。
文件详解
- 文件名称:
Xu et al raw SNP genotyping data_Heredity.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含99份长豇豆及普通豇豆种质资源的1127个表达序列标签衍生单核苷酸多态性(EST-SNP)标记的原始基因分型数据,具体字段可能涵盖材料编号、SNP标记位点、基因分型结果等基础遗传数据(因无预览暂无法提供详细字段列表)。
数据来源
Xu et al在Heredity发表的研究(对应论文标题:Genome wide linkage disequilibrium in Chinese asparagus bean (Vigna. unguiculata ssp. sesquipedialis) germplasm: implications for domestication history and genome wide association studies)
适用场景
- 作物遗传多样性分析:用于解析中国长豇豆种质资源的遗传变异水平与群体遗传结构特征。
- 基因组连锁不平衡研究:分析长豇豆不同亚群及染色体水平的LD衰减模式与分布规律。
- 作物驯化历史探究:通过LD方差分区及比较分析,推断长豇豆驯化过程中受选择的染色体区域与性状。
- 全基因组关联分析支撑:为长豇豆复杂农艺性状的关联定位提供基因型数据基础。
- 作物分子育种应用:为长豇豆分子标记辅助选择及遗传改良提供基因组水平的数据参考。