数据集概述
本数据集围绕牙齿发育过程中的分子保守模式与进化压力的关联展开，包含基因表达水平、正选择扫描结果、多效性估计数据、小鼠与仓鼠间dN/dS值及样本注释表等核心内容，为研究进化压力对牙齿发育分子机制的影响提供数据支持。
文件详解
- 样本注释表：
- 文件名称: metadata.tsv
- 文件格式: TSV
- 字段示例: name（样本名）、species（物种）、age（年龄）、batch（批次）、stade（发育阶段）、nb_read（总读段数）、prop_map（映射比例）等
- 基因表达水平数据压缩包:
- 文件名称: Expression_levels_Tables.zip
- 文件格式: ZIP
- 内容: 包含原始计数和TPM标准化的基因表达水平表格
- 正选择扫描结果压缩包:
- 文件名称: Positive_Selection_data.zip
- 文件格式: ZIP
- 内容: 含Selectome分析结果，包括cricetinae分支的res.ham.tsv、mus/murinae/muridae分支的res.mus.tsv
- 多效性估计数据压缩包:
- 文件名称: Pleiotropy_data.zip
- 文件格式: ZIP
- 内容: 含Bgee数据（全发育/胚胎期/胚胎后期3类）、门齿/臼齿scRNA-seq数据，使用tau列评估多效性
- dN/dS值数据压缩包:
- 文件名称: dNdS_data.zip
- 文件格式: ZIP
- 内容: 小鼠与仓鼠间的dN/dS值数据
- 样本权重文件:
- 文件名称: sample_S1_weight.csv
- 文件格式: CSV
- 内容: 样本S1的权重数据
适用场景
- 进化生物学研究：分析牙齿发育相关基因的进化选择压力与分子保守模式的关联
- 发育生物学研究：探究不同物种牙齿发育阶段的基因表达特征及多效性分布
- 分子进化分析：利用dN/dS值和正选择扫描结果，研究啮齿类动物牙齿相关基因的适应性进化
- 基因组学实验设计：通过样本注释表优化牙齿发育相关的测序实验设计与数据解读
