芽囊原虫ST1株水平基因转移候选基因系统发育树与功能域组成数据集

数据集概述

本数据集聚焦芽囊原虫ST1株(Blastocystis sp. ST1)的水平基因转移(LGT)候选基因,包含其系统发育树构建结果及功能域组成分析,为研究该寄生虫基因水平转移的进化机制提供可视化数据支持。

文件详解

该数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体如下: - 文件名称: Eme_etal_SupplementalPhylogenies.pdf - 文件格式: PDF (.pdf) - 文件内容: - 左侧展示ML系统发育树(中点根化),仅显示超快速 bootstrap支持值≥70的节点 - 序列标记:芽囊原虫同源序列为红色,其他为黑色;末端彩色方块代表门水平分类(蓝绿色=细菌、紫色=古菌、三文鱼色=真核生物) - 右侧显示Genbank注释及通过hmmscan推断的功能域组成(域大小和位置),无功能域检测(e值>10e-3)标记为“?” - 页面左上角标识符对应表S1中的基因座编号

适用场景

  • 寄生虫分子进化研究:分析芽囊原虫ST1株水平基因转移事件的进化背景
  • 功能基因组学:探究水平转移候选基因的功能域组成及其潜在生物学功能
  • 微生物遗传学:验证芽囊原虫与其他生物类群间的基因交流机制
  • 系统发育分析:辅助构建芽囊原虫相关基因的进化关系树
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 23.47 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
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