数据集概述
本数据集为烟管螺科(Clausiliidae)陆生蜗牛的系统发育研究补充数据,包含多组系统发育分析的输入文件、结果文件及设置文档,支持对该科物种演化关系的深入探究。
文件详解
- 系统发育分析输入文件:
- MrBayes分析输入文件(如MrBayes analysis 3 partitions.nex、MrBayes analysis unpartitioned.nex等):NEX格式,用于贝叶斯系统发育分析的参数设置与数据分区文件
- BEAST分析输入文件(如BEAST analysis 3 partitions.xml、BEAST analysis unpartitioned.xml等):XML格式,用于时间校准的贝叶斯系统发育分析输入文件
- 系统发育树结果文件:
- BEAST最大分支可信度树文件(如BEAST maxcladecredibilitytree with mean node heights _ node posterior probabilities.pdf等):PDF格式,展示含节点后验概率、95%HPD节点年龄的系统发育树
- MrBayes与PhyML树文件(如MrBayes 28S majrule contree.pdf、PhyML Maximum likelihood bootstrap tree 1000 replicates.pdf等):PDF格式,分别为贝叶斯合意树与最大似然法 Bootstrap 树
- BEAST树文本文件(BEAST maxcladecredtree with mean node heights.txt):TXT格式,NEXUS格式的系统发育树文本数据,含73个分类单元信息
- 分析设置文档:
- Settings PhyML bootstrap analysis.doc:DOC格式,PhyML Bootstrap分析的参数设置说明文档
适用场景
- 软体动物系统发育研究:分析烟管螺科物种间的演化关系与分类地位
- 分子系统学方法验证:对比不同系统发育分析方法(MrBayes、BEAST、PhyML)的结果差异
- 生物多样性研究:基于系统发育树探究烟管螺科物种的演化历史与地理分布关联
- 演化生物学教学:作为系统发育分析实践的案例数据,辅助理解不同分析工具的应用逻辑