药物活性预测化合物生物活性数据集_Compound_Bioactivity_Prediction_Dataset
数据来源:互联网公开数据
标签:药物研发,生物活性,化合物,机器学习,预测模型,药理学,靶点,高通量筛选
数据概述:
该数据集包含用于药物活性预测的化合物生物活性数据,主要用于构建和评估预测模型。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态数据集。
地理范围:数据来源未明确,但适用于全球药物研发和药理学研究。
数据维度:数据集包含两种主要类型的文件:
.pth文件:包含预训练模型或中间结果,文件名表明了不同的模型训练方式(ALL_TARGETS_FOLDx_.pth和SCORED_ONLY_FOLDx_.pth),其中x代表交叉验证的折数。
submission.csv:包含药物化合物的ID(sig_id)和针对多种生物靶点的预测活性概率,涉及多种药理学靶点,例如“5-alpha_reductase_inhibitor”、“11-beta-hsd1_inhibitor”等。
数据格式:数据以.pth和CSV格式提供,.pth文件用于存储模型参数或中间结果,submission.csv文件为CSV格式,方便数据分析和模型评估。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于药物研发、生物信息学和药理学研究,用于分析化合物与生物靶点的相互作用,以及开发新的药物预测模型。
行业应用:为制药公司和生物技术公司提供数据支持,用于药物筛选、靶点识别和临床前药物活性预测。
决策支持:支持药物研发过程中的决策制定,包括化合物选择、实验设计和候选药物的优先级排序。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习和药物研发课程的实训材料,帮助学生和研究人员深入理解药物活性预测的原理和方法。
此数据集特别适合用于构建和评估药物活性预测模型,探索化合物的生物活性与结构之间的关系,以及优化药物研发流程。