数据集概述
本数据集记录了通过实验进化研究芽殖酵母(Saccharomyces)孢子形成适应性价值的过程与结果。核心内容为五株酵母菌株经昆虫传代或移液传代后,资源耗尽时孢子形成倾向的变化,揭示昆虫传代对孢子产生的选择作用及驯化对该过程的影响。
文件详解
- 说明文档:
- README_EvoMan3.txt: TXT格式,提供数据集基本信息,包括标题、作者、机构等背景内容。
- 原始数据文件:
- YeastSporulationData.csv: CSV格式,包含实验数据,字段示例有Experiment Date(实验日期)、Strain isolate replicate(菌株分离复本)、treatment type(处理类型)、number vegetative cells at 2.5 days(2.5天营养细胞数)等。
- 统计模型文件:
- AncModels.RData: R语言数据格式,可能存储祖先菌株相关的统计模型数据。
- FittedModels.RData: R语言数据格式,可能包含拟合后的统计模型数据。
- 统计报告与代码:
- LTEE_Main_Stats.pdf: PDF格式,展示主要统计结果。
- LTEE_Main_Stats.Rmd: R Markdown格式,用于生成统计报告的代码文件。
- 数据可视化代码:
- RawDataFigures.Rmd: R Markdown格式,用于生成原始数据图表的代码文件。
适用场景
- 微生物进化研究: 分析环境选择压力(如昆虫传代)对酵母孢子形成能力进化的影响。
- 驯化遗传学研究: 探究酵母驯化过程中对环境信号响应及孢子形成启动的遗传稳定性变化。
- 进化生态学研究: 验证资源获取与保护之间的权衡策略在微生物适应性进化中的作用。
- 实验进化方法学: 作为实验进化研究设计与数据分析的参考案例,包括复本设置、处理对照及表型测定方法。