蝇属Chiastocheta系统发育分析数据集

数据集概述

本数据集包含用于蝇属Chiastocheta(双翅目:花蝇科)系统发育和系统基因组分析的原始数据文件,支持RAD测序技术在物种辐射类群系统发育关系解析中的潜力评估研究。

文件详解

  • 文件名称: Chiastocheta_c75d6m20p10-blk-bad.alleles:pyRAD格式的RAD-seq数据等位基因文件
  • 文件名称: Chiastocheta_c75d6m20p10-blk-bad.phy:Phylip格式的RAD-seq数据串联文件
  • 文件名称: Chiastocheta_COI_COII_dloop.phy:Phylip格式的线粒体DNA(COI、COII、D-loop)串联文件(移除超过50%个体存在间隙的区域)
  • 文件名称: Chiastocheta_COI_COII_dloop.partitions:上述线粒体DNA串联文件的分区文件
  • 文件名称: Chiastocheta_COI_COII.phy:Phylip格式的线粒体DNA(COI、COII)串联文件
  • 文件名称: Chiastocheta_COI_COII.partitions:上述线粒体DNA串联文件的分区文件

适用场景

  • 分子系统发育研究:解析蝇属Chiastocheta物种辐射类群的系统发育关系
  • 基因组学方法评估:验证RAD-seq技术在近缘物种系统发育解析中的应用价值
  • 线粒体DNA分析:基于COI、COII等基因片段开展物种进化研究
  • 生物信息学方法应用:测试不同序列分区策略对系统发育分析结果的影响
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 6.85 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
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