数据集概述
本数据集是研究银屑病与补骨脂素暴露对皮肤体细胞突变景观影响的研究资料，包含多类型文件，覆盖患者细胞分群、组织学图像、突变特征、系统发育树、空间关系矩阵及测序数据等，为相关医学与生物学研究提供数据支持。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下：
- cluster_cell_fractions/目录：
- 文件名称：patientXX_cluster_and_samples.csv（如patient05_cluster_and_samples.csv）
- 文件格式：CSV
- 内容：包含患者样本的细胞分群比例及突变分配数量等字段，如cluster_id、no.of.mutations.assigned
- Histology/目录：
- 文件名称：PXXH_LL_slX.jpg、PXXL_T.slX.jpg等（如P01H_LL_sl4.jpg）
- 文件格式：JPG
- 内容：患者皮肤组织学图像
- Miscellaneous/目录：
- 文件名称：PUVA_signature_hdp_component.txt、RT_1_hg38.bed、tcga_drivers_with_puva_context.xlsx等
- 文件格式：TXT、BED、XLSX、RDAT等
- 内容：PUVA突变特征概率数据、基因组区域注释、TCGA驱动基因与PUVA突变背景关联数据、协变量数据等
- Phylogenetic_trees_SBS/目录：
- 文件名称：patientXX.cluster_tree.phylo、patientXX.edge_tbl.csv、patientXX.cluster_tree.pdf等
- 文件格式：PHYLO、CSV、PDF
- 内容：患者单碱基替换突变的系统发育树文件、树结构边表数据、系统发育树可视化PDF
- Spatial_relationship_matrices/目录：
- 文件名称：PXXL_spatMatrix.txt、PXXH_spatMatrix.txt等（如P04L_spatMatrix.txt）
- 文件格式：TXT
- 内容：患者样本的空间关系矩阵数据
- pileups/目录：
- 文件名称：patientXX/patientXX_alts.tsv、patientXX/patientXX_covs.tsv
- 文件格式：TSV
- 内容：患者样本的测序突变位点替代碱基数据及覆盖度数据
适用场景
- 皮肤医学研究：分析银屑病与补骨脂素暴露对皮肤体细胞突变的影响机制
- 基因组学研究：探究皮肤体细胞突变景观的特征及形成规律
- 药理学研究：评估补骨脂素相关治疗的潜在突变风险
- 病理学研究：结合组织学图像与突变数据解析皮肤病变的分子基础
- 生物信息学分析：开发或验证皮肤体细胞突变的分析算法与模型
