数据集概述
该数据集围绕西班牙三家医院的环境真菌评估展开，结合DNA宏条形码与定量PCR技术，分析空气、表面、灰尘和土壤等样本的真菌群落多样性、组成及空气载量，对比培养法数据，揭示医院真菌组特征及影响因素。
文件详解
- 元数据文件：
- Mycospitalomics_metadata_complete.xlsx：Excel格式，包含三家医院两季采样的完整样本元数据，涉及医院、区域、样本类型、采样时间等信息
- annotation_col_metadata.xlsx、annotation_col_metadata_hts_vent.xlsx：Excel格式，样本列注释文件，补充元数据字段说明
- 分类学与OTU数据文件：
- all_OTUS_table.xlsx、OTU_table_lulu_curated_lca.xlsx、otutable_fungi_filtered_rar.xlsx：Excel格式，OTU表文件，包含过滤、校正后的真菌分类单元丰度数据
- tax_stacked_genus_hospital_zone_autumn_air_2.xlsx、tax_stacked_genus_hospital_zone_winter_air_2.xlsx、tax_stacked_genus_hospital_zone_autumn_vent_1.xlsx：Excel格式，按属水平堆叠的分类学丰度表，分医院、区域、季节和样本类型统计
- Mycospitalomics_OTU_rep_ITS2_seq.centroids：centroids格式，OTU代表性ITS2序列文件
- 分析结果与代码文件：
- adonis_results.xlsx：Excel格式，群落组成差异的Adonis分析结果
- mycospitalomics2_I_data_preparation.html：HTML格式，数据预处理步骤文档
- mycospitalomics2_II_statistical_analyses.R：R格式，统计分析代码脚本
- 说明文档：
- README_Mycospitalomics_metabarcoding.txt：TXT格式，数据集说明文档，包含作者、 publication信息及原始测序数据存储位置
适用场景
- 医院环境微生物学研究：分析不同区域、季节的真菌群落特征与潜在风险
- 感染控制应用：识别医院环境中潜在机会性致病真菌，辅助制定感染防控策略
- 分子生态学方法学验证：对比DNA宏条形码与传统培养法在环境真菌评估中的应用效果
- 公共卫生监测：为医院建设、通风系统优化及微生物暴发调查提供数据支持
